Lấy bối cảnh năm , năm sau khi Indiana Jones và cuộc viễn chinh cuối cùng ra mắt, phim kể về cuộc chuyến phiêu lưu mới nhất của nhà thám hiểm dũng cảm. Lần này, ông phải tìm ra Crystal Skull (sọ pha lê), một đồ vật bí hiểm có nguồn gốc từ ngoài hành tinh chứa đựng sức mạnh khủng khiếp.